因为蓝藻的分布非常广泛，遍地都是。它是早期光合作用释放氧气的重要存在。它可以有许多蓝藻（如鱼腥藻），可以直接固定大气中的氮素，提高土壤肥力，为农作物提供能量供应，增加农作物产量。 .还有蓝藻，为人们的身体提供食用所必需的营养物质，如著名的发菜、普通野菜（土木耳）、螺旋藻等，都是人们餐桌上常见的藻类食品。
但由于藻类繁殖生长能力强，它们在丰富的水中大量繁殖，在水面形成一层带有蓝绿色藻类气味的蓝绿色泡沫，称为“开花”。蓝藻大面积爆发，导致“绿潮”使水质恶化，严重导致水中大量生物鱼因缺氧而死亡，将造成严重损失水产养殖农民。
便携式蓝绿藻分析仪由便携式主机和便携式叶绿素传感器组成。叶绿素传感器利用叶绿素在光谱中有吸收峰和发射峰的特性，在叶绿素的光谱吸收峰处发出单色光照射到水中，水中的叶绿素吸收单色光的能量并释放出另一个波长发射峰的单色光，叶绿素发出的光强与水中叶绿素的含量成正比。